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颅内动脉瘤差异表达基因的生信分析及免疫浸润的相关性分析
刘江, 张云东, 犹秋香
目的 本研究试图通过使用综合生物信息学分析来鉴定颅内动脉瘤的差异表达基因(DEGs) 并揭示其潜在机制。
方法 利用基因表达综合(GEO)下载GSE13353数据集信息。在DAVID中进行了DEG的基因本体(GO) 功能分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG) 通路富集分析。STRING数据库用于评估DEG的相互作用并使用 Cytoscape 软件构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络。使用 CytoHubba 插件选择Hub基因,鉴定枢纽基因网络。利用CIBERSORT评估IA组织中免疫细胞的浸润情况。
结果 鉴定了93个DEGs,其中有50个上调的基因,43个下调的基因。GO分析结果表明,DEGs在质膜、细胞外区、细胞外间隙细胞内信号转导和免疫反应中显著富集。KEGG通路分析表明,DEGs在趋化因子通路中富集。筛选了前10个中枢基因,包括TLR2、FPR1、CCR1、FCGR3B、CD14、CXCL8、FGR、CD163、AQP9和TNFRSF1B。免疫细胞浸润分析发现滤泡辅助性T细胞、肥大细胞、幼稚B细胞、巨噬细胞 M2和中性粒细胞与IA的破裂有关。
结论 本研究确定了一系列可能参与颅内动脉瘤进展的关键基因和通路,此外,免疫细胞浸润在IA的发生和发展中起重要作用,为IA破裂的潜在分子机制提供了新的认识。
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